在美国政府居间调停下，10月4日至13日在亚的斯亚贝巴举行了阿卜耶伊问题谈判，结束时，《全面和平协议》各方同意举行第二轮谈判，由非洲联盟高级别执行小组主持，以讨论全面和平协议方面所有未决问题以及全民投票后的安排。联苏特派团同非洲联盟高级别执行小组和其他利益攸关方密切协作，以支持调解努力。11月7日，执行小组在喀土穆举行苏丹人民解放运动和全国大会党高级代表全体会议，向他们提出了《解决有关执行全面和平协议的未决问题以及北苏丹与南苏丹未来关系的框架》草案。草案内容包括：立即开始划界工作，维持“软边界”，允许经济和社会活动及交流；在全面和平协议过渡期间，不要修改任何苏丹人的国籍和公民身份等规定。
在11月7日至13日、由非洲联盟高级别执行小组促成的谈判期间，双方重申致力于“争取顺利举行苏丹南方全民投票”，并且承诺尊重投票结果，但在阿卜耶伊和公民身份问题上没有达成协议。关于阿卜耶伊的谈判被推迟，预期将在正副总统级别继续进行。双方同意将就这些问题继续进行讨论，但2010年底，并没有结束讨论。
2010年底，举行了若干次关于苏丹问题的高级别会议。11月6日，非洲联盟在亚的斯亚贝巴举行了苏丹协商论坛。11月23日，政府间发展管理局就苏丹问题举行了管理局国家元首和政府首脑第十六次特别首脑会议。双方都派出高级代表团参加这两次活动。11月6日和7日，苏丹政府代表、国际和国家两级的学者以及其他专家还在喀土穆出席了由联合国难民事务高级专员办事处(难民高专办)和联苏特派团联合召开的专题讨论会，商讨全民投票后公民身份方面的技术和法律问题。
11月7日至13日，由非洲联盟高级别执行小组主持的谈判期间，双方在1-1-56边界段指明了5个争议地区，并商定可在联苏特派团技术和后勤援助下，立即开始其他地区的实际划界工作。
边界地区的各个社区正在探讨全民投票后的跨界安排。10月份在达马津举行的为期三天的讲习班期间，来自南科尔多凡州、上尼罗州、白尼罗州和青尼罗州的代表要求设立联合警察部队、联合原住民行政法院，举行州级联合边界委员会定期会议以及沿边界线统一税收和关税工作。